近日,首款云南地方猪100K液相育种芯片“滇芯1号”发布,标志着云南省在地方猪基因组育种领域迈出关键一步。
云南是我国地方猪种资源大省,这些地方猪长期在高原独特多样的生态环境中演化,遗传结构复杂、性能差异明显,在品种精准鉴定、亲缘关系核验和良种选育等方面,对专用分子工具提出了更高要求。现有商业化猪SNP芯片多以瘦肉型猪种为基础设计,难以满足云南地方猪种质资源保护和精准育种的需求。

“滇芯1号”(资料图)。
研发团队对迪庆藏猪、滇南小耳猪、丽江猪、大河猪、撒坝猪等10个云南地方猪进行了高深度全基因组重测序,筛选高质量变异位点,构建了包含10.8509万个高多态性SNP位点的专用高密度分子标记体系,覆盖生长、繁殖、肉质、抗逆等多类重要经济性状位点及针对云南地方猪的高分辨率品种鉴别标记体系,可有效支持品种鉴定、外来血缘监测、群体纯度评估和亲缘关系核验,为地方猪种质资源保护和基因组育种提供标准化分子工具。

“滇芯1号”核心标记位点注释与功能位点(资料图)。
测试结果表明,“滇芯1号”平均位点检出率达98.99%,芯片分型结果与全基因组重测序的一致率达99.87%,整体性能稳定可靠,可用于云南地方猪遗传距离评估、种质资源指纹图谱构建、育种材料筛选以及性状调控位点挖掘等研究与实践应用场景。

研发团队部分成员(资料图)。
该成果由云南农业大学严达伟教授领衔的高原地方猪基因资源发掘与利用团队牵头、联合华中农业大学赵书红院士团队和武汉影子基因科技有限公司共同完成,得到了云南省赵书红专家工作站项目和云南省重大科技专项项目支持,是云南省持续推进地方畜禽种质资源保护与育种科技创新的重要成果,为云南地方猪精准育种提供了低成本高通量的便捷工具,为云南省高原特色现代生猪种业高质量发展提供了重要科技支撑。(完)





